Terdiri atas Gubernur dan Wakil Gubernur dibantu oleh 3 Staf Ahli, Sekretaris Daerah, 3 Asisten, Inspektur, 9 Kepala Badan, Sekretaris DPRD, 23 Kepala Dinas, 9 Kepala Biro, Kepala Satpol PP dan 3 Direktur RS

Struktur Organisasi, Tugas, Wewenang & Fungsi tertuang dalam : 

• Peraturan Gubernur Maluku Nomor 99 Tahun 2021 Tentang Kedudukan, Tugas Dan Fungsi, Susunan Organisasi Dan Tata Kerja Sekretariat Daerah, Sekretariat Dewan Perwakilan Rakyat Daerah, Dan Inspektorat Daerah Provinsi Maluku
• Peraturan Gubernur Maluku Nomor 100 Tahun 2021 Tentang Kedudukan, Tugas Dan Fungsi, Susunan Organisasi Dan Tata Kerja Dinas Daerah Provinsi Maluku
• Peraturan Gubernur Maluku Nomor 101 Tahun 2021 Tentang Kedudukan, Tugas Dan Fungsi, Susunan Organisasi Dan Tata Kerja Badan Daerah